八、药师神咒
1、定境中的咒语
药师佛一心一意为拔除众生业障之苦而努力修行，由此进入定境。定境中发出具有巨大力量的咒语。经云：
时彼世尊，入三摩地，名曰除灭一切众生苦恼。既入定已，于肉髻中出大光明，光中演说，大陀罗尼曰：南谟薄伽伐帝，鞞杀社窭噜辟琉璃，钵喇婆，喝啰?也，怛陀揭多耶，阿啰诃帝，三藐三勃陀耶。怛侄他。唵，鞞杀逝，鞞杀逝，鞞杀社，三没揭帝，娑诃。
药师如来成佛以后，一心一意行除灭众生苦恼之事，存除灭众生苦恼之念，其他一切心念都不起，专注于一行，进入了一行三昧之定境。三昧即三摩地，意思是定、正定、一境性。凡专心致志地做一件事，二六时中行住坐卧，念念在在都不离所专注之事，做到一行，便入定境，《三藏法数》说：「一行三昧者，惟专一行，修习正定也。」六祖慧能在坛经中说：「一行三昧者，于一切处，行住坐卧常行一直心是也。」一直心即专注不变之心。凡一心念佛或一心行持，都可达一行三昧定境。
药师如来时时刻刻，念念不忘，一心一意从事的是除灭众生苦恼之事，所以他进入的三昧定境名叫除灭众生苦恼定。如经文所说：「时彼世尊，入三摩地，名曰除灭一切众生苦恼。」「时」即药师佛一心一意救助众生之时。「彼世尊」即药师佛世尊。
佛三十二相中，有无见顶相。观佛经说：「佛顶肉髻生亿万光，光光相次，乃至上方无量世界，诸天世人，十地菩萨亦不能见。」无见顶表明佛的智慧深不可测，无法超越。药师如来成佛后，肉髻中也会放射无量光明。所以经文说：「既入定已，与肉髻中，出大光明。」
药师佛在定中，在智慧之光的笼罩下，为众生演说了具有无比威力的咒语，所以经文说「光中演说，大陀罗尼」。
陀罗尼是梵语的译音，意思是总持，能摄持一切善法，遮障一切罪恶，总一切法，持无量意。
陀罗尼有四种：一、法陀罗尼，于佛之教法闻持而不忘，又叫闻陀罗尼;二、义陀罗尼，于诸法之义总持而不忘;三、咒陀罗尼，依禅定发秘密语，有不测之神验，又叫咒语;四、忍陀罗尼，于法之实相能安住叫忍，能持忍所以叫忍陀罗尼。
佛菩萨在禅定中所发秘密语之所以称为咒陀罗尼是因为佛菩萨之定力能总持神咒功德。大乘义章说：「菩萨依禅能起咒术，为众除患第一神验。」此秘密语能总持无量文义、具无尽之功德。佛地论说，佛菩萨之秘密语「于一法中持一切法，于一文中持一切文，于一义中持一切义，摄藏无量诸功德，故名无尽藏」。显教经典中对咒陀罗尼有五种称谓，分别为：陀罗尼、明、咒、密语、真言。药师佛定中演说的陀罗尼，就被称作药师神咒。
药师佛在禅定中发出了具无穷无尽含义的咒语，此咒语能持一切功德，作用极其伟大，所以称之为「大陀罗尼」，即是秘密语，在译经时都不做意译，只直译其音。咒的神验就在于它能以一种特殊的声音信号与宇宙信息，或说他在的外力相沟通，所以，凡咒语都应按其原来的读音持诵。这里特用汉语拼音将这一神咒的读音注出来，便于读者读诵。
南谟薄伽伐帝。 鞞杀社。 窭噜薛琉璃。
钵喇婆。喝啰阇也。 怛他揭多也。
阿啰喝帝。三藐三勃陀耶。 怛侄他。
唵。鞞杀逝。 鞞杀逝。 鞞杀社。三没揭帝莎诃。
「南谟」又作南无，意思是皈依，皈命。「薄伽伐帝」即薄伽梵的异译。「鞞杀社窭噜」意思是药师。「辟琉璃」即琉璃。「钵喇婆」意思是光。「喝啰阇也」意思是王。「怛陀揭多耶」意思是如来。「阿啰诃帝」意思是应供。「三藐三勃陀耶」即正等正觉。「怛侄他」意思是即说咒曰。「唵」为发音词。「鞞杀逝，鞞杀逝，鞞杀社」意思是「药!药!药!」「三没揭帝」意思是普遍救度一切众生。「娑诃」亦可做娑婆诃，意思是迅速成就。综上所述，这段经文中，释迦佛告诉大家，由于药师如来成佛后一心一意只行救助众生之事，所以进入了一行三昧的禅定中，他所入的定就叫「除灭一切众生苦恼」定。禅定中药师佛肉髻放大光明，光明中药师佛发出了具备特别伟大的功德的咒语，咒语说：
「皈依世尊药师琉璃光王如来、应供、正等正觉。即说咒曰：唵!药!药!药!用药治愈一切众生疾苦，使之急速痊愈。」
